सीएसई विभाग के पास जेएनटीयू द्वारा निर्धारित आवश्यक प्रयोगशाला गतिविधियों का संचालन करने के लिए अच्छी तरह से सुसज्जित प्रयोगशालाएं और लाइसेंस प्राप्त सॉफ्टवेयर हैं। प्रत्येक प्रयोगशाला में १५० वर्गमीटर आयामों का एक तल क्षेत्र है और १२० छात्र/सप्ताह काम कर रहे हैं। निम्नलिखित विभिन्न प्रयोगशालाओं और किए गए प्रयोगों के बारे में जानकारी देता है।

कंप्यूटर प्रोग्रामिंग लैब- I: सीपी लैब- I में कुल 60 एसर वेरिटॉन सिस्टम हैं। सभी I वर्ष B.Tech C प्रोग्रामिंग और डेटा स्ट्रक्चर / ITWS लैब्स लैब स्लॉट के अनुसार आयोजित किए जाते हैं।  

कंप्यूटर प्रोग्रामिंग लैब- II:  CP Lab-II में कुल 90 Dell और HP सिस्टम हैं। सभी II/III/IV वर्ष की प्रयोगशालाओं (Oracle, UNIX, Web Technologies, ST&CT, Java, OS, CD) को लैब स्लॉट के अनुसार आयोजित किया जा रहा है।

कंप्यूटर प्रोग्रामिंग लैब-III:  सीपी लैब-II में कुल 70 डेल सिस्टम हैं। इस लैब में ऑटो सीएडी/रेड हैट लिनक्स को लैब स्लॉट के अनुसार आयोजित किया जा रहा है।